注册监理工程师挂靠一般分为建设部、水利部、交通部的三个部门的证书。之所以这样分是因为涉及到水利监理资质、公路、铁路、港口的监理资质的审批，其审批权并不在建设部而是分布有交通部和水利部来负责审批。建设部收到企业的资质申报材料以后也是转交给交通部和水利部审核。这其中涉及到各个部门间的权利，自己的地盘肯定不是能有其他部门做主，不然处处受制于人，还如何能管理本部门的企业和实务。
就目前的注册监理工程师挂靠价格来看，建设部注册监理工程师挂靠价格最高，其次是交通部的注册监理工程师挂靠，价格较低，需求较少的是水利部的注册监理工程师挂靠价格。这个也跟我们印象中的情况完全相符。一般来说，建设部的证书需求最大，资质数量最多，考核也最为严格，因此市场上的注册监理工程师挂靠多数属于建设部的。而交通部涉及到道路，桥梁、公路等资质，需求相对也算挺多，因此其挂靠价格也是比建设部的稍低。水利资质由于大多数市场化程度较低，一般都还是属于各个水利、流域、河域的管理内部企业，故而需求量不是很大，市场化程度不高，价格也就起不来。
从挂靠价格来说，在挂靠注册监理工程师时，当然选择注册监理工程师建设部挂靠最为划算。不过，这个现象很快会消除，国家已经明确提出，和注册造价工程师挂靠一样，监理工程师挂靠也将取消部门之间的差别，实行各个部门统一，到时候就不在区分建设部、水利部、还是交通部的注册监理工程师证书挂靠。挂靠价格已将归于统一。
